高通量测序中准确度Q20，Q30表示什么

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高通量测序中,每测一个碱基会给出一个相应的质量值,这个质量值是衡量测序准确度的.碱基的质量值13,错误率为5%,20的错误率为1%,30的错误率为0.1%.Q20与Q30则表示质量值大于等于20或30的碱基所占百分比.比如一共测了1G的数据量,其中有0.9G的碱基质量值大于或等于20,那么Q20则为90%.

其他类似问题

问题1：第二代高通量测序都有哪些平台

Illumina公司的Solexa测序平台,目前主流的型号的HiSeq-2500,以及Hiseq-2000,数据通量在每张Flow cell 300G数据,每次最多可以上2张Flow cell,单张Flow cell运行时间大约在11天左右.读长通常是100BP,据说近期有了长度上的突破.还有一个型号是MiSeq,该机器运行通量较小,但是读长大约在150BP以上,常用于微生物检测,而且该型号获得FDA认证,可以进行临床样本的检测.Solexa的错误类型主要是颠换.

罗氏454平台,主要特点是测序长度很长,目前大于1K的测序没有什么难度了,比较适合基因组测序,用于搭建基因组框架,也常用于微生物基因组测序.该平台主要的错误类型是插入缺失.

ABI的SoLID平台,听说该平台不在维护了,故而不再描述.

Life的Ion torrent平台,目前主要有2种型号,较早的一个型号是PGM,该测序仪原理类似于454测序,与454不同的是,454是化学反应发光进行检测,而PGM是半导体测序,检测H离子,如果发生了碱基互补配对,那么高能磷酸键就会释放H离子,导致电位变化,从而根据已知加入的碱基,就可以判断待测序列是否与已知加入的碱基发生互补,从而达到测序目的,测序长度可以达到400BP,主要用于微生物的检测,错误类型也是插入缺失错误.最新的型号是IonProton,该机器与PGM测序原理一致,但是测序通量由PGM的1G数据上升至10G数据,测序精度也较PGM有大幅度提升,测序时间大约是1天.

PacBio的单分子三代测序,该测序仪最大的特点就是测序长度比454更长,更加有利于基因组的拼接工作,有些较小的微生物可以直接将基因组测通成环状.

问题2：高通量测序和重测序是怎么回事啊?还有一个相位的概念，Here,wedemonstrate a method in which allele-specific polymerase chain reaction (AS-PCR) and computational phasing are combined for relatively high-throughput,efficient resolu[语文科目]

是这样的,高通量测序分为好多种,有不同的平台运作,共同的特点是极高的测序通量,相对于传统测序的96道毛细管测序,高通量测序一次实验可以读取40万到 400万条序列.读取长度根据平台不同从25bp到450bp,不同的测序平台在一次实验中,可以读取1G到14G不等的碱基数,这样庞大的测序能力是传统测序仪所不能比拟的.

重测序就是说,基于第二代测序,也可以是第一代的,对之前的测过序的基因组再测一边,并对个体或者群体样品进行分析.基因组的重测序可以辅助研究者发现单核苷酸多态性位点（SNPs）、拷贝数变异（Copy Number Variation,CNV）、插入（Insertion）、缺失（Deletion）等变异类型,以最廉价的方式将单个参考基因组信息扩增为生物群体的遗传特征.短序列（Short-Reads）与双末端（Paired-End）,以及不同插入长度双末端的组合,使我们能够更深入地了解到序列和序列以外的基因组结构变异.

相位,就是说在测序的时候,测序的结果 会出现在电脑上,这个就叫做相位.在深一点就比较专业了,我还没用过第二代测序,也不太清楚.但是,据我所知相位经常会出现出现“超前”和“延迟”的现象.

问题3：测序的分辨率（resolution）是什么意思?在高通量测序里经常出现的词汇[化学科目]

resolution 在测序的时候是指对碱基信号的分辨能力,尤其是在达到测序极限后（一般的机器为几百碱基对,就会出现信号模糊,无法再分辨了,这就是分辨率不行了

问题4：高通量测序时如何证明覆盖度已经接近完整?

可以做测序覆盖度评估,提供reference和测序结果进行比对.

问题5：高通量测序分的原理

高通量测序的原理与特色

高通量测序：高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(deep sequencing).

Illumina公司的新一代测序仪Genome AnalyzerIIx具有高准确性,高通量,高灵敏度,和低运行成本等突出优势,可以同时完成传统基因组学研究（测序和注释）以及功能基因组学 （基因表达及调控,基因功能,蛋白/核酸相互作用）研究.Illumina Genome AnalyzerIIx是一种基于单分子簇的边合成边测序技术,基于专有的可逆终止化学反应原理.测序时将基因组DNA的随机片段附着到光学透明的玻璃表面（即Flow cell）,这些DNA片段经过延伸和桥式扩增后,在Flow cell上形成了数以亿计Cluster,每个Cluster是具有数千份相同模板的单分子簇.然后利用带荧光基团的四种特殊脱氧核糖核苷酸,通过可逆性终止的SBS（边合成边测序）技术对待测的模板DNA进行测序.

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